Preview

Медико-биологические проблемы жизнедеятельности

Расширенный поиск

Метилирование ДНК в образцах буккального эпителия человека в связи с определением возраста

Аннотация

На основании биоинформатического и статистического анализа GEO-проектов по определению полногеномного профиля метилирования ДНК человека сформирован перечень из CpG-динуклеотидов с высоким прогностическим потенциалом для создания моделей предсказания возраста человека по образцам буккального эпителия. Определен уровень метилирования для 466 образцов индивидов из Республики Беларусь, рассчитаны коэффициенты корреляции R и построены математические модели определения возраста человека. Среднее значение точности предсказания возраста по образцам буккального эпителия составило 4,6 года. Полученные результаты будут положены в основу при разработке калькуляторов предсказания возраста индивида по биологическим следам для экспертов-криминалистов.

Об авторах

В. А. Лемеш
ГНУ «Институт генетики и цитологии» НАН Беларуси
Россия


В. Н. Кипень
ГНУ «Институт генетики и цитологии» НАН Беларуси
Россия


М. В. Богданова
ГНУ «Институт генетики и цитологии» НАН Беларуси
Россия


А. А. Буракова
ГНУ «Институт генетики и цитологии» НАН Беларуси
Россия


А. Г. Булгак
Государственное учреждение «РНПЦ «Кардиология»
Россия


А. В. Байда
ГУО «Белорусская медицинская академия последипломного образования»
Россия


О. В. Зотова
Государственное учреждение «РНПЦ «Кардиология»
Россия


М. А. Кругликова
Государственное учреждение «РНПЦ «Кардиология»
Россия


О. И. Добыш
ГНУ «Институт генетики и цитологии» НАН Беларуси
Россия


В. И. Сакович
ГНУ «Институт генетики и цитологии» НАН Беларуси
Россия


Список литературы

1. Assessment of DNA Damage by Comet Assay in Buccal Epithelial /j. Sanchez-Alarcon J. [et al.] // Cells: Problems, Achievement, Perspectives, Environmental Health Risk. - 2016. - P. 77-135. DOI:10.5772/61472

2. Генетика - судебной экспертизе Беларуси / А. Кильчевский [и др.] // Наука и инновации. - 2020. - № 10(212). - С. 22-28.

3. Improved age determination of blood and teeth samples using a selected set of DNA methylation markers / B. Bekaert [et al.] // Epigenetics. - 2015. - Vol. 10(10). - P. 922-930. DOI: 10.1080/15592294.2015.1080413

4. Postmortem age estimation via DNA methylation analysis in buccal swabs from corpses in different stages of decomposition-a «proof of principle» study / B.E. Koop [et al.] // International Journal of Legal Medicine. - 2021. - Vol. 135(1). - P. 167-173. DOI: 10.1007/s00414-020-02360-7

5. Epigenetic age predictions based on buccal swabs are more precise in combination with cell type-specific DNA methylation signatures / M. Eipel [et al.] // Aging (Albany NY). - 2016. - Vol. 8(5). - P. 1034-1048. DOI: 10.18632/aging.100972

6. The PedBE clock accurately estimates DNA methylation age in pediatric buccal cells / L.M. McEwen [et al.] // PNAS. - 2020. - Vol. 22;117(38). - P. 23329-23335. DOI: 10.1073/pnas.1820843116

7. Genome-wide analysis of DNA methylation in buccal cells: a study of monozygotic twins and mQTLs /j. Dongen [et al.] // Epigenetics Chromatin. - 2018. - Vol. 25, 11(1). - P. e1-e14. DOI: 10.1186/s13072-018-0225-x

8. Development of the VISAGE enhanced tool and statistical models for epigenetic age estimation in blood, buccal cells and bones / A. Wozniak [et al.] // Aging (Albany NY). - 2021. - Vol.15;13(5). - P. 6459-6484. DOI: 10.18632/aging.202783

9. Impact of genetic ancestry on chronological age prediction using DNA methylation analysis /j. Fleckhaus [et al.] // Forensic Science International: Genetics. Supplement Series. - 2017. - Vol.6. - P. e399-e400. DOI: 10.1016/j.fsigss.2017.09.162

10. Sperm epigenetics and influence of environmental factors / I. Donkin, R. Barres // Molecular Metabolism. - 2018. - Vol.14. - P. e1-e11. DOI: 10.1016/j.molmet.2018.02.006

11. DNA methylation-based age prediction from saliva: High age predictability by combination of 7 CpG markers / S. R. Hong [et al.] // Forensic Science International: Genetics. - 2017. - Vol.29. - P. 118-125. DOI: 10.1016/j.fsigen.2017.04.006

12. Предсказательный потенциал CpG-маркеров для определения хронологического возраста человека / В.Н. Кипень [и др.] // Молекулярная и прикладная генетика. - 2020. - №.28. - С. 70-80.


Рецензия

Для цитирования:


Лемеш В.А., Кипень В.Н., Богданова М.В., Буракова А.А., Булгак А.Г., Байда А.В., Зотова О.В., Кругликова М.А., Добыш О.И., Сакович В.И. Метилирование ДНК в образцах буккального эпителия человека в связи с определением возраста. Медико-биологические проблемы жизнедеятельности. 2021;(2):44-52.

For citation:


Lemesh V.A., Kipen V.N., Bahdanava M.V., Burakova A.A., Bulgak A.G., Bayda A.V., Zotova O.V., Kruglikova M.A., Dobysh O.I., Sakovich V.I. DNA methylation in human buccal epithelium samples in determining age. Medical and Biological Problems of Life Activity. 2021;(2):44-52. (In Russ.)

Просмотров: 63


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2074-2088 (Print)