Метилирование ДНК в образцах буккального эпителия человека в связи с определением возраста

На основании биоинформатического и статистического анализа GEO-проектов по определению полногеномного профиля метилирования ДНК человека сформирован перечень из CpG-динуклеотидов с высоким прогностическим потенциалом для создания моделей предсказания возраста человека по образцам буккального эпителия. Определен уровень метилирования для 466 образцов индивидов из Республики Беларусь, рассчитаны коэффициенты корреляции R и построены математические модели определения возраста человека. Среднее значение точности предсказания возраста по образцам буккального эпителия составило 4,6 года. Полученные результаты будут положены в основу при разработке калькуляторов предсказания возраста индивида по биологическим следам для экспертов-криминалистов.

криминалистика, определение возраста, буккальный эпителий, метилирование ДНК, HumanMethylation450 BeadChip

1. Assessment of DNA Damage by Comet Assay in Buccal Epithelial /j. Sanchez-Alarcon J. [et al.] // Cells: Problems, Achievement, Perspectives, Environmental Health Risk. - 2016. - P. 77-135. DOI:10.5772/61472

2. Генетика - судебной экспертизе Беларуси / А. Кильчевский [и др.] // Наука и инновации. - 2020. - № 10(212). - С. 22-28.

3. Improved age determination of blood and teeth samples using a selected set of DNA methylation markers / B. Bekaert [et al.] // Epigenetics. - 2015. - Vol. 10(10). - P. 922-930. DOI: 10.1080/15592294.2015.1080413

4. Postmortem age estimation via DNA methylation analysis in buccal swabs from corpses in different stages of decomposition-a «proof of principle» study / B.E. Koop [et al.] // International Journal of Legal Medicine. - 2021. - Vol. 135(1). - P. 167-173. DOI: 10.1007/s00414-020-02360-7

5. Epigenetic age predictions based on buccal swabs are more precise in combination with cell type-specific DNA methylation signatures / M. Eipel [et al.] // Aging (Albany NY). - 2016. - Vol. 8(5). - P. 1034-1048. DOI: 10.18632/aging.100972

6. The PedBE clock accurately estimates DNA methylation age in pediatric buccal cells / L.M. McEwen [et al.] // PNAS. - 2020. - Vol. 22;117(38). - P. 23329-23335. DOI: 10.1073/pnas.1820843116

7. Genome-wide analysis of DNA methylation in buccal cells: a study of monozygotic twins and mQTLs /j. Dongen [et al.] // Epigenetics Chromatin. - 2018. - Vol. 25, 11(1). - P. e1-e14. DOI: 10.1186/s13072-018-0225-x

8. Development of the VISAGE enhanced tool and statistical models for epigenetic age estimation in blood, buccal cells and bones / A. Wozniak [et al.] // Aging (Albany NY). - 2021. - Vol.15;13(5). - P. 6459-6484. DOI: 10.18632/aging.202783

9. Impact of genetic ancestry on chronological age prediction using DNA methylation analysis /j. Fleckhaus [et al.] // Forensic Science International: Genetics. Supplement Series. - 2017. - Vol.6. - P. e399-e400. DOI: 10.1016/j.fsigss.2017.09.162

10. Sperm epigenetics and influence of environmental factors / I. Donkin, R. Barres // Molecular Metabolism. - 2018. - Vol.14. - P. e1-e11. DOI: 10.1016/j.molmet.2018.02.006

11. DNA methylation-based age prediction from saliva: High age predictability by combination of 7 CpG markers / S. R. Hong [et al.] // Forensic Science International: Genetics. - 2017. - Vol.29. - P. 118-125. DOI: 10.1016/j.fsigen.2017.04.006

12. Предсказательный потенциал CpG-маркеров для определения хронологического возраста человека / В.Н. Кипень [и др.] // Молекулярная и прикладная генетика. - 2020. - №.28. - С. 70-80.