medbioМедико-биологические проблемы жизнедеятельностиMedical and Biological Problems of Life Activity2074-2088Республиканский научно-практический центр радиационной медицины и экологии человекаmedbio-229Research ArticleМЕДИКО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ ПРОБЛЕМЫMEDICAL-BIOLOGICAL PROBLEMSМетилирование ДНК в образцах буккального эпителия человека в связи с определением возрастаDNA methylation in human buccal epithelium samples in determining ageЛемешВ. А.LemeshV. A.noemail@neicon.ruКипеньВ. Н.KipenV. N.noemail@neicon.ruБогдановаМ. В.BahdanavaM. V.noemail@neicon.ruБураковаА. А.BurakovaA. A.noemail@neicon.ruБулгакА. Г.BulgakA. G.noemail@neicon.ruБайдаА. В.BaydaA. V.noemail@neicon.ruЗотоваО. В.ZotovaO. V.noemail@neicon.ruКругликоваМ. А.KruglikovaM. A.noemail@neicon.ruДобышО. И.DobyshO. I.noemail@neicon.ruСаковичВ. И.SakovichV. I.noemail@neicon.ruГНУ «Институт генетики и цитологии» НАН БеларусиRussian FederationГосударственное учреждение «РНПЦ «Кардиология»Russian FederationГУО «Белорусская медицинская академия последипломного образования»Russian Federation202102032023024452Copyright © Лемеш В.А., Кипень В.Н., Богданова М.В., Буракова А.А., Булгак А.Г., Байда А.В., Зотова О.В., Кругликова М.А., Добыш О.И., Сакович В.И., 20232023Лемеш В.А., Кипень В.Н., Богданова М.В., Буракова А.А., Булгак А.Г., Байда А.В., Зотова О.В., Кругликова М.А., Добыш О.И., Сакович В.И.Lemesh V.A., Kipen V.N., Bahdanava M.V., Burakova A.A., Bulgak A.G., Bayda A.V., Zotova O.V., Kruglikova M.A., Dobysh O.I., Sakovich V.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://medbio.ejournal.by/jour/article/view/229

На основании биоинформатического и статистического анализа GEO-проектов по определению полногеномного профиля метилирования ДНК человека сформирован перечень из CpG-динуклеотидов с высоким прогностическим потенциалом для создания моделей предсказания возраста человека по образцам буккального эпителия. Определен уровень метилирования для 466 образцов индивидов из Республики Беларусь, рассчитаны коэффициенты корреляции R и построены математические модели определения возраста человека. Среднее значение точности предсказания возраста по образцам буккального эпителия составило 4,6 года. Полученные результаты будут положены в основу при разработке калькуляторов предсказания возраста индивида по биологическим следам для экспертов-криминалистов.

Based on bioinformatics and statistical analysis of GEO-projects to determine the genome-wide profile of human DNA methylation, a list of CpG dinucleotides with high predictive potential was formed to create models for predicting human age from buccal epithelium samples. The methylation level was determined for 466 samples of individuals from the Republic of Belarus. The correlation coefficients R were calculated, and mathematical models for determining the age of individual were constructed. The average value of the accuracy of age prediction from buccal epithelium samples using 6 CpG-dinucleotides was 4,6 years. The results obtained will be used as a basis for the development of calculators for predicting the age of an individual based on traces of biological character for forensic experts.

криминалистикаопределение возрастабуккальный эпителийметилирование ДНКHumanMethylation450 BeadChipforensicage determinationbuccal epitheliumDNA methylationhuman methylation 450k BeadChipReferencesAssessment of DNA Damage by Comet Assay in Buccal Epithelial /j. Sanchez-Alarcon J. [et al.] // Cells: Problems, Achievement, Perspectives, Environmental Health Risk. - 2016. - P. 77-135. DOI:10.5772/61472Assessment of DNA Damage by Comet Assay in Buccal Epithelial /j. Sanchez-Alarcon J. [et al.] // Cells: Problems, Achievement, Perspectives, Environmental Health Risk. - 2016. - P. 77-135. DOI:10.5772/61472Генетика - судебной экспертизе Беларуси / А. Кильчевский [и др.] // Наука и инновации. - 2020. - № 10(212). - С. 22-28.Генетика - судебной экспертизе Беларуси / А. Кильчевский [и др.] // Наука и инновации. - 2020. - № 10(212). - С. 22-28.Improved age determination of blood and teeth samples using a selected set of DNA methylation markers / B. Bekaert [et al.] // Epigenetics. - 2015. - Vol. 10(10). - P. 922-930. DOI: 10.1080/15592294.2015.1080413Improved age determination of blood and teeth samples using a selected set of DNA methylation markers / B. Bekaert [et al.] // Epigenetics. - 2015. - Vol. 10(10). - P. 922-930. DOI: 10.1080/15592294.2015.1080413Postmortem age estimation via DNA methylation analysis in buccal swabs from corpses in different stages of decomposition-a «proof of principle» study / B.E. Koop [et al.] // International Journal of Legal Medicine. - 2021. - Vol. 135(1). - P. 167-173. DOI: 10.1007/s00414-020-02360-7Postmortem age estimation via DNA methylation analysis in buccal swabs from corpses in different stages of decomposition-a «proof of principle» study / B.E. Koop [et al.] // International Journal of Legal Medicine. - 2021. - Vol. 135(1). - P. 167-173. DOI: 10.1007/s00414-020-02360-7Epigenetic age predictions based on buccal swabs are more precise in combination with cell type-specific DNA methylation signatures / M. Eipel [et al.] // Aging (Albany NY). - 2016. - Vol. 8(5). - P. 1034-1048. DOI: 10.18632/aging.100972Epigenetic age predictions based on buccal swabs are more precise in combination with cell type-specific DNA methylation signatures / M. Eipel [et al.] // Aging (Albany NY). - 2016. - Vol. 8(5). - P. 1034-1048. DOI: 10.18632/aging.100972The PedBE clock accurately estimates DNA methylation age in pediatric buccal cells / L.M. McEwen [et al.] // PNAS. - 2020. - Vol. 22;117(38). - P. 23329-23335. DOI: 10.1073/pnas.1820843116The PedBE clock accurately estimates DNA methylation age in pediatric buccal cells / L.M. McEwen [et al.] // PNAS. - 2020. - Vol. 22;117(38). - P. 23329-23335. DOI: 10.1073/pnas.1820843116Genome-wide analysis of DNA methylation in buccal cells: a study of monozygotic twins and mQTLs /j. Dongen [et al.] // Epigenetics Chromatin. - 2018. - Vol. 25, 11(1). - P. e1-e14. DOI: 10.1186/s13072-018-0225-xGenome-wide analysis of DNA methylation in buccal cells: a study of monozygotic twins and mQTLs /j. Dongen [et al.] // Epigenetics Chromatin. - 2018. - Vol. 25, 11(1). - P. e1-e14. DOI: 10.1186/s13072-018-0225-xDevelopment of the VISAGE enhanced tool and statistical models for epigenetic age estimation in blood, buccal cells and bones / A. Wozniak [et al.] // Aging (Albany NY). - 2021. - Vol.15;13(5). - P. 6459-6484. DOI: 10.18632/aging.202783Development of the VISAGE enhanced tool and statistical models for epigenetic age estimation in blood, buccal cells and bones / A. Wozniak [et al.] // Aging (Albany NY). - 2021. - Vol.15;13(5). - P. 6459-6484. DOI: 10.18632/aging.202783Impact of genetic ancestry on chronological age prediction using DNA methylation analysis /j. Fleckhaus [et al.] // Forensic Science International: Genetics. Supplement Series. - 2017. - Vol.6. - P. e399-e400. DOI: 10.1016/j.fsigss.2017.09.162Impact of genetic ancestry on chronological age prediction using DNA methylation analysis /j. Fleckhaus [et al.] // Forensic Science International: Genetics. Supplement Series. - 2017. - Vol.6. - P. e399-e400. DOI: 10.1016/j.fsigss.2017.09.162Sperm epigenetics and influence of environmental factors / I. Donkin, R. Barres // Molecular Metabolism. - 2018. - Vol.14. - P. e1-e11. DOI: 10.1016/j.molmet.2018.02.006Sperm epigenetics and influence of environmental factors / I. Donkin, R. Barres // Molecular Metabolism. - 2018. - Vol.14. - P. e1-e11. DOI: 10.1016/j.molmet.2018.02.006DNA methylation-based age prediction from saliva: High age predictability by combination of 7 CpG markers / S. R. Hong [et al.] // Forensic Science International: Genetics. - 2017. - Vol.29. - P. 118-125. DOI: 10.1016/j.fsigen.2017.04.006DNA methylation-based age prediction from saliva: High age predictability by combination of 7 CpG markers / S. R. Hong [et al.] // Forensic Science International: Genetics. - 2017. - Vol.29. - P. 118-125. DOI: 10.1016/j.fsigen.2017.04.006Предсказательный потенциал CpG-маркеров для определения хронологического возраста человека / В.Н. Кипень [и др.] // Молекулярная и прикладная генетика. - 2020. - №.28. - С. 70-80.Предсказательный потенциал CpG-маркеров для определения хронологического возраста человека / В.Н. Кипень [и др.] // Молекулярная и прикладная генетика. - 2020. - №.28. - С. 70-80.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.